Особую красоту возведенному зданию храма придавали изразцы. Они стали применяться в Новгороде с XVI века, и ими часто были украшены многие сооружения города, построения или перестроения в XVII веке. Среди них: звонница Софийского собора, Преображенский собор Хутынского монастыря, сооружения Вяжищского монастыря.
До сих пор точно не известно где изготовлялись изразцы для Вяжищского монастыря. Некоторые исследователи считают, что, всего скорее всего, роскошная мозаика для Вяжищской обители под Новгородом была заказана в Москве, Ярославле или в Иверском монастыре на Валдае. В ходе раскопок в Новгороде было найдено довольно много изразцов XVII века. Они представляли собой квадратные керамические плитки, имеющие рельефный рисунок, покрытый эмалью 5-ти цветов: синего, бирюзового, желтого, белого и коричневого.
В Вяжищском монастыре изразцы введены в декор крылец, также используются как вставки на галереях, в обрамлении окон и двери, применены в нишах стен, проемов, в широких фризах по всему зданию трапезной, в украшении парапетов лестничных всходов, барабанов глав.
Можно разделить изразцы того времени на 3 группы: печные (21,5х22,5), помещенные высоко в основании на крыльцах и галереях Никольского собора, средние (30,5х31,5) и большие (37,5х38), используемые специально для декора фасадов. Встречаются изразцы, представляющие собой плитки, соединенные под прямым углом, изразцы со средним углом, которые применялись при украшении оконных наличников.
Чаще всего на небольших изразцах изображались цветочные букеты в вазоне и геометрические фигуры. Средние и большие изразцы более разнообразны по рисункам: на плитках единорог , двуглавый орел, крест, ваза с крупным цветком-плодом и т.д. Это многообразие сюжетов особенно заметно на церкви Иоанна Богослова. Причем нижний ярус ее свободен от изразцов, второй же ярус, наоборот, поражает обилием изразцовых украшений, подчеркивающих значимость верхнего этажа.
Можно также увидеть на многих изразцах изображения животных — они всегда в движении, часто одинаковы по окраске: фон бирюзовый, тело желтое, грива, хвост, копыта окрашены в белый, синий, коричневый цвета. Если мы присмотримся к изображениям единорога и льва, то увидим, например, что оба зверя похожи друг на друга. Отличие только в том, что единорог имеет рог и копыта, а у льва — длинный хвост с кисточкой.
Изразцы с изображением креста менее декоративны. Смысловое значение тех, которые применены как вставки на колокольне и на пилястрах между апсидами храма, подчеркивается подписями, Иисус Христос. Изразцы с крестами из нижнего фриза, на южном фасаде, потеряли религиозную окраску и имеют лишь декоративный вид. Кресты являются четырехконечными. Как правило, они синие, с желтыми или коричневыми концами на бирюзовом фоне.
Необходимо подчеркнуть, что архитектурные сооружения обители являются бесценным памятником культуры Новгородской земли. Монастырь славится необыкновенным разнообразием изразцов, украшающих здание храмового комплекса. В Николо-Вяжишском женском монастыре в настоящее время две действующие церкви: в честь Евфимия архиепископа Новгородского, чудотворца и собор в честь святого Николая архиепископа Мир Ликийских, чудотворца, который был восстановлен и освящен 19 мая 2000 года. Два храма: в честь Апостола и Евангелиста Иоанна Богослова с трапезной и храм Вознесения Господня в стадии реставрации.